CLASIFICACIÓN DE LOS VIRUS QUE INFECTAN ARQUEAS

Posted on febrero 23rd, 2012 in General by anjuro

Existen dos grandes criterios para clasificar a los virus que infectan arqueas:

MORFOLÓGICAMENTE:

  • FUSIFORMES
  • FORMA DE BOTELLA Y GOTA
  • LINEARES 
  • ESFÉRICOS 
  • CABEZA-COLA

•SEGÚN ARCHAEAS INFECTADAS:

  • DE EURYCHAEOTAS
  • DE CRENARCHAEOTAS

Generalmente es más popular  la clasificación morfológica debido a que estos virus  tienen unas morfologías muy peculiares.

Ahora examinaremos grupo por grupo cada uno de los tipos de virus que infectan  Arqueas previamente mencionados:

FUSIFORMES

  • Se llaman así por su morfología en forma de huso.
  • Gran variabilidad por lo que respecta a características y estructura génica.
  • Poseen un gen integrasa que facilita la incorporación en el cromosoma del huésped
  • Grandes agrupaciones:

FUSELLOVIRIDAE, FUSELLOVIRUS :

– Su replicación y liberación dejan la célula huésped intacta.

– Situaciones de estrés inducen la replicación viral y la inhibición temporal del crecimieto del lisógeno sin causar su lisis.

FUSELLOVIRIDAE, SALTERPROVIRUS :

-Codifica una DNA polimerasa.

FUSIFORMES NO CLASIFICADOS:

– Poseen ORFs  que codifican productos implicados en modificación de DNA.  Complejo patrón de metilación del DNA.

BICAUDAVIRIDAE:

-Llamados así porque aunque su porción central tiene forma de huso, de aquí surgen de forma opuesta, dos prolongaciones a modo de colas que le dan ese aspecto tan inusual.

-Los viriones son  liberados de las células hospedadoras como partículas fusiformes, sin cola.

-Desarrollan largas colas con temperaturas por encima de 75ºC.

-Independiente del huésped o de ninguna fuente de energía.

– Su mecanismo molecular no está claro.

De esta «familia» de virus más adelante comentaré el curioso ciclo vital de Acidianus convivator.


VIRUS CON FORMA DE BOTELLA Y DE GOTA:

  • Dos virus ABV y el SNDV tienen características morfológicas tan específicas que cada uno ha sido asignado a una familia nueva
  • Familia Ampullaviridae(ABV):

-ADN polimerasa como Salterprovirus.

– Molécula RNA que con similitud a la estructura secundaria del RNA implicado en el empaquetamiento del DNA del bacteriófago ф29

  • SNDV :

-Genoma circular dsADN extensamente modificado por metilación.

-No ha sido secuenciado.

VIRUS LINEALES:

  • Genoma dsDNA lineal.
  • Rudiviridae: rígidos como barras.
  • Lipothrixviridae: flexibles y filamentosos.
  • Gran fracción de genes ortologos son compartidos por ambos.
  • No presentan el gen integrador.
  • Su replicación no se induce por factores de estrés.
  • Patrón múltiple de repeticiones al término del genoma del AFV1.

VIRUS ESFÉRICOS:

  • Dos tipos principales:

-Globuloviridae

-No clasificados.

  • Genomas lineales.
  • SH1 es un virus lítico
  • STV1 no es lítico, y permanece estable en la célula hospedadora.


VIRUS CABEZA- COLA

  • Morfología parecida a los bacteriófagos.
  • Todos ellos asociados al reino Euryarcheota.

-Siphoviridae

-Myoviridae

Bueno, espero que hayáis podido digerir esto último aunque se que es bastante difícil, lo que pretendía era que se viera la gran diversidad y complejidad morfológica y funcional de estos virus, la próxima entrada será mucho más llevadera.

CONTINUO EN LA SIGUIENTE PÁGINA LLAMADA «VIRUS CONCRETOS»



Introducción

Posted on febrero 16th, 2012 in General by anjuro


En esta introducción recordaremos aspectos básicos de las Arqueas que son importantes para comprender bien como se clasifican y estudian los virus que afectan a estos microorganismos.

Las Arqueas son un grupo de microorganismos relativamente desconocidos, ya que no hace tanto tiempo que se descubrieron, y los avances que se han hecho en su conocimiento nos permiten comprender hoy en día bastantes cosas de este grupo tan raro e interesante de la naturaleza.

Los ambientes en que se encuentran las Arqueas son típicamente extremófilos, y para poder soportar esas condiciones ambientales en las que ningún otro ser vivo puede estar, modifican su fisiología y metabolismo de tal forma  que se clasifican en:

  • Halófilos
  • Termófilos
  • Alcalófilos
  • Basófilos

Ahora vamos a ver como se clasifican las Arqueas, ya que esto es importante para después clasificar a los virus que las infectan:

  • Euryarchaeota: Es uno de los dos grupos principales de arqueas y originalmente fue separado del otro grupo (Crenarchaeota) basándose en las secuencias del ARNr. Son procariontes simples y abarcan un conjunto amplio y diverso de microorganismos.
  • Crenarchaeota: Es el otro grupo principal de arqueas que se distinguió en función del ARNr. Se pensaba que incluía sólo organismos hipertermófilos, frecuentemente quimiosintetizadores dependientes del azufre. Sin embargo, estudios recientes los han identificado como las arqueas más abundantes en el ecosistema marino.
  • Nanoarchaeota: Es un taxón especialmente creado para la especie Nanoarchaeum equitans, descubierta en 2002 y cuyas relaciones de parentesco son inciertas, es decir no saben dónde colocarla dentro del dominio Archaea.

Para acabar esta introducción comentaré dos curiosidades sobre Arqueas:

¿Sabías que?

  • Su nombre hace referencia a que son una forma de vida muy antigua:

Se han datado fósiles probables de estas células hace casi 3.500 millones de años, y se han detectado restos de lípidos que podrían ser arqueobacterias o eucariotas en esquistos de hace 2.700 millones de años. Estos lípidos han sido detectados en rocas que datan del Precámbrico. Los restos más antiguos conocidos de lípidos de isopreno datan del cinturón de Isua, al oeste de Groenlandia, que incluyen sedimentos formados hace 3.800 millones de años, siendo estos los más antiguos encontrados hasta la fecha. Este linaje parece ser el más antiguo de la tierra.

  • Algunos autores han especulado que estos microorganismos tienen propiedades (extremofilia) típicas de la vida Extraterrestre, incluso se ha sugerido que estos microbios podrían viajar por el espacio en meteoritos y llegar viables a otro planeta.

Hola, món!

Posted on febrero 15th, 2012 in General by anjuro

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